Cuối cùng, Bale cũng có thể trở lại sau khi một loạt tờ báo Tây Ban Nha khẳng định anh đã bình phục chấn thương cơ. Nhưng không ai rõ anh sẽ thi đấu được bao lâu trước vận đen mang tên chấn thương vẫn đeo đuổi cầu thủ này trong suốt 1 năm qua. Đây là quãng thời gian đáng quên với chữ ký kỷ lục của Real Madrid, và đôi khi người ta không còn nhận ra sự góp mặt của Bale trong đội hình Kền kền nữa.
Tháng 11/2016 đến tháng 1/2017: Chấn thương mắt cá, bỏ lỡ hàng loạt trận đấu quan trọng
Sau trận gặp Sporting Lisbon tại vòng bảng UEFA Champions League mùa 2016/2017, Gareth Bale dính chấn thương dây chằng mắt cá và phải trải qua cơn phẫu thuật tại bệnh viện King Edward VII tại London. Ca phẫu thuật thành công, nhưng những vấn đề thể chất sau ca phẫu thuật ấy đeo đẳng Bale rất lâu sau đó và nó khiến anh bỏ lỡ nhiều trận đấu quan trọng của mùa giải.
Trận cầu lớn đầu tiên Bale phải ngồi ngoài là Siêu kinh điển diễn ra tháng 12 năm 2016 – trận đấu Real đã có trận hòa 1-1 với Barca. Sau đó, Real lên đường thi đấu giải FIFA Club World Cup và đương nhiên Bale cũng không thể thi đấu. Giải đấu đó, nhà vô địch châu Âu Real Madrid lên ngôi vô địch sau khi đánh bại Club America ở bán kết và Kashima Antlers ở chung kết.
Sau đấy, Gareth Bale bước vào những ngày đầu năm mới vẫn trong quá trình hồi phục chấn thương. Trong khoảng thời gian vắng Bale, Real Madrid đã xác lập kỷ lục bất bại tại La Liga, nhưng lại bị loại khỏi cúp nhà vua.
Tháng 2/2017 đến tháng 6/2017: Trở lại, thẻ đỏ, lại chấn thương và lên ghế dự bị
Tháng 2 năm 2017 đánh dấu sự trở lại của Gareth Bale sau thời gian dài chữa trị chấn thương. Anh tái xuất ngày 18/2 trong trận đấu với Espanyol và ghi một bàn thắng. Cũng trong khoảng thời gian này Bale tiếp tục ra sân trước các đối thủ Valencia và Villareal.
Tuy vậy, tháng tệ hại của Bale bắt đầu với một tấm thẻ đỏ. Sau pha đẩy Jonathan Viera của Las Palmas trong trận đấu thuộc khuôn khổ La Liga, Bale nhận thẻ đỏ và bị treo giò 2 trận. Bale sau đó trở lại nhưng cũng có rất ít đóng góp cho Real Madrid bởi những di chứng của chấn thương mắt cá trước đó. Anh vẫn phải nén đau để thi đấu.
Như một hệ quả, cầu thủ người Xứ Wales lại phải trở lại bàn mổ. Chấn thương mắt cá để lại di chứng khiến Bale không thể có thể trạng ổn định nhất và khiến anh gặp phải những vấn đề về cơ. Tuy nhiên, Bale vẫn phải ra sân thi đấu, và thậm chí chơi trận siêu kinh điển ngày 23/4 trước khi nằm sân ở trận đấu đó và bị thay ra vì quá đau.
Sau đó, Bale bỏ lỡ hàng loạt trận đấu quan trọng của Real trong đó có 2 trận bán kết Champions League với hàng xóm Atletico Madrid. Bale cũng không thể tham dự trận cuối cùng của mùa giải với Malaga – trận đấu quyết định chức vô địch La Liga cho Real Madrid.
Đỉnh điểm của nỗi thất vọng đến ở trận chung kết Champions League với Juventus. Bale khi ấy đã bình phục chấn thương, nhưng anh chỉ là sự lựa chọn thứ 2 sau Isco. Cựu cầu thủ của Tottenham chỉ được vào sân vài phút ngắn ngủi sau khi trận đấu đã an bài.
Cũng trong giai đoạn này, Bale cũng không thể tham dự loạt trận với tuyển Xứ Wales tại vòng loại World Cup và nó ảnh hưởng rất lớn đến thành tích của đội tuyển nước này.
Tháng 7/2017 đến tháng 10/2017: Sống quanh tin đồn, mất vé dự World Cup
Bước vào kì chuyển nhượng hè, những tin đồn liên quan tới Gareth Bale xuất hiện dày đặc trên các mặt báo. Real có ý định chiêu mộ Kylian Mbappe, và báo chí châu Âu đưa tin Bale sẽ trở thành một phần của thương vụ này. Sau đó, đến lượt Manchester United ngỏ ý muốn chiêu mộ tiền đạo 28 tuổi. Nhưng phát biểu trên báo giới, Bale nói rằng anh muốn ở lại và chứng minh giá trị tại Real.
Tuy vậy, quãng thời gian này cũng chứng kiến những giây phút tỏa sáng ít ỏi của Bale. Anh hoàn toàn hồi phục trước mùa giải mới, và góp mặt ở cả 2 trận tranh siêu cúp Tây Ban Nha với Barcelona. Bale sau đó chơi thêm 5 trận nữa ở giải quốc nội và 2 trận tại Champions League.
Tuy vậy, Bale một lần nữa đối mặt với kẻ thù cũ: chấn thương. Ngày 26/9, Real gặp Dortmund trong khuôn khổ Champions League và Bale để lại dấu ấn với một bàn thắng, nhưng sau đó lại phải rời sân vì chấn thương. Sau trận, Zidane nói rằng Bale chỉ bị chuột rút, nhưng những kết luận về chấn thương của tiền đạo người Xứ Wales cho thấy anh đã dính chấn thương đùi.
Sau chấn thương ấy, Bale cũng không thể đóng góp nhiều cho đội tuyển Xứ Wales trong việc cạnh tranh cho 1 tấm vé tới World Cup 2018. Như một hệ quả, Xứ Wales không thể có vé dự World Cup – một thành tích đáng thất vọng với đội bóng một năm trước còn nằm trong top 4 đội mạnh nhất châu Âu.
Chưa dừng lại ở đó, Bale cũng không còn được bình chọn là cầu thủ xuất sắc nhất Xứ Wales nữa, sau 5 năm liên tiếp anh nhận danh hiệu này. Tiền đạo 28 tuổi cũng nằm ngoài danh sách đề cử 30 cái tên cho danh hiệu Quả bóng vàng.
Tháng 11/2017: Sự trở lại của Gareth Bale?
Tháng 11 bắt đầu với sự quyết tâm trở lại của Bale trong trận đấu với Atletico Madrid vào ngày 18. Bale trở lại tập luyện vào đầu tháng, nhưng đến ngày 10/11, cơ bắp của anh lại có vấn đề. Những kết luận ban đầu cho rằng Bale sẽ phải ngồi ngoài 1 tháng, nhưng có vẻ như tiền đạo người Xứ Wales có thể quay trở lại sớm hơn.
Liệu đây có phải là sự trở lại của Bale, hay anh lại phải sống trong nỗi thất vọng mang tên chấn thương?