Bunyodkor được thành lập từ năm 2005. Dù là đội bóng non trẻ, với tiềm lực tài chính dồi dào, CLB thủ đô nhanh chóng có được thành công với 5 chức vô địch quốc gia. Bên cạnh việc bỏ tiền chiêu mộ những ngôi sao hàng đầu như trường hợp Rivaldo vào năm 2008, đội bóng của nhà tài phiệt Miradil Djalalov cũng rất chú trọng đến công tác đào tạo trẻ.
Học viện bóng đá của CLB Bunyodkor được ra đời vào ngày 26/1/2007 và có trụ sở đặt tại quận Shaykhantaur, thành phố Taskent. Qua quá trình tuyển chọn kỹ lưỡng, các cậu bé tại đây sẽ được chia thành 10 nhóm dựa vào độ tuổi. Hiện tại, có 773 học viên đang tập luyện ở học viện của đội bóng thủ đô.
Sau khi được sửa chữa và cải tạo vào năm 2012, lúc này, học viện sở hữu 4 sân cỏ tự nhiên và 3 sân nhân tạo. Tất cả được trang bị hệ thống phòng tắm, đèn và các tiện ích cần thiết.
Ngoài ra, học viện còn có bể bơi trong nhà, phòng gym, phòng học chiến thuật, khu vực y tế hiện đại, phòng ăn và khu vực ký túc.
Nước uống được chuẩn bị trong một buổi tập của đội trẻ CLB Bunyodkor.
Tại học viện, mỗi đội trẻ có ít nhất 2 HLV, trong đó tuyển nhỏ nhất là U9. Để dễ dàng theo dõi, thông tin các cầu thủ nhí được đăng tải trên trang web chính thức của đội bóng. Ngoài việc học kỹ năng trên sân, các học viên còn được trải nghiệm các buổi làm việc nhóm ngoài trời nhằm tăng sự đoàn kết.
Điều đặc biệt ở học viện của Bunyodkor là họ rất quan tâm đến tâm lý các học viên. Môn tâm lý được đưa vào chương trình giảng dạy, vì thế, các cầu thủ nhí giữ được sự bình tĩnh trong những trận đấu căng thẳng. Ngoài ra, ngoại ngữ cũng được chú trọng tại đây.
Nhờ cách đào tạo chuyên nghiệp, Bunyodkor đã cung cấp nhiều tài năng trẻ cho đội tuyển quốc gia. Tại giải U20 World Cup 2015 ở New Zealand, cả 6 bàn thắng của Uzbekistan đều được ghi bởi những cầu thủ thuộc biên chế của Bunyodkor. Nhìn chung, sự thành công của bóng đá Uzbekistan thời gian qua là nhờ tính hợp lý của công tác đào tạo trẻ, trong đó không thể bỏ qua sự đóng góp đến từ CLB Bunyodkor.
