1) 09/12/2003: U23 Việt Nam – U23 Malaysia: 4-3
Ở giải đấu được tổ chức trên sân nhà Mỹ Đình, U23 Việt Nam đã chơi rất hay dưới sự dẫn dắt của HLV Alfred Riedl. Xếp thứ 2 vòng bảng, U23 Việt Nam gặp U23 Malaysia ở trận bán kết rất được chờ đợi. Với những khán giả có mặt trên sân khi ấy, đây chắc chắn là một trong những trận đấu giàu cảm xúc nhất tại SEA Games của U23 Việt Nam.
Ở trận đấu đó, U23 Việt Nam dẫn trước 2-1 rồi 3-1 nhờ bàn thắng của Quốc Vượng, và cú đúp của thần đồng một thời Văn Quyến. Tuy nhiên, sự chủ quan đã khiến U23 Việt Nam suýt phải nhận trái đăng khi để đối thủ ghi liền 2 bàn ở những phút cuối. Rất may, tiền đạo Phan Thanh Bình đã tỏa sáng đúng lúc với cú đánh đầu chuẩn xác ở phút cuối, ấn định tỷ số 4-3 và đưa Việt Nam vào chung kết.
2) Chung kết SEA Games 25 (2009)
Ở kì SEA Games năm 2009, U23 Việt Nam đã thi đấu rất thăng hoa trong suốt giai đoạn vòng bảng và trận bán kết. Trong đó, có chiến thắng 3-1 trước Malaysia. Sau đó, 2 đội gặp lại nhau ở trận chung kết. Hàng triệu NHM mảnh đất chữ S đã kì vọng vào chiếc huy chương vàng SEA Games đầu tiên sau nhiều năm khao khát.
Thế nhưng, U23 Việt Nam của HLV Calisto đã thi đấu cực kỳ bế tắc trước trận địa phòng ngự của U23 Malaysia. Phút 85, từ một quả tạt bóng không quá nguy hiểm từ bên cánh trái, trung vệ Mai Xuân Hợp lúng túng đưa bóng về lưới nhà, khiến U23 Việt Nam nhận thất bại, có thể gọi là đau đớn nhất trong lịch sử các kì SEA Games.
3. Bán kết lượt đi AFF Cup 2010
Đây là giải đấu mà Malaysia đã lên ngôi vô địch trong sự ngạc nhiên của rất nhiều người. Ở trận bán kết lượt đi trên sân của đối phương, ĐT Việt Nam dưới sự chỉ đạo của HLV Henrique Calisto đã thi đấu không thành công và chịu thất bại với tỷ số 0-2. Sau đó hai đội cầm chân nhau trong trận lượt về với tỷ số 0-0.
Sau khi bị loại khỏi bán kết AFF Cup 2010, Việt Nam chia tay cặp tiền vệ xuất sắc Minh Phương – Tài Em. HLV Calisto cũng từ chức ngay sau đó.
4. Bán kết lượt về AFF Cup 2014
Cho tới bây giờ, thất bại 2-4 trước Malaysia trong trận bán kết lượt về AFF Cup 2014 trên sân Mỹ Đình vẫn được coi là một trong những trận cầu khó hiểu nhất trong lịch sử bóng đá Việt Nam.
Bán kết lượt đi trên đất Mã, đoàn quân của HLV Miura chơi tuyệt hay và giành chiến thắng 2-1. Nhưng rồi các hậu vệ của ĐT Việt Nam lại “tự bắn vào chân”, phạm những lỗi sơ đẳng và để lọt lưới tới 4 bàn ở trận lượt về, qua đó “tặng” chiếc vé vào trận chung kết cho đối thủ Malaysia.
5. Vòng bảng AFF Cup 2016
Ở giải đấu cách đây 2 năm, ĐT Việt Nam tiếp tục chạm trán Malaysia tại vòng bảng. Đoàn quân của HLV Hữu Thắng đã thi đấu khá chật vật và chỉ có thể vượt qua đối thủ với tỷ số 1-0 bằng bàn thắng duy nhất của Trọng Hoàng trong những phút cuối cùng. Trận thua này cũng khiến ĐT Malaysia bị loại sau khi vòng bảng khép lại.